El logotipo de la Universidad Autónoma de Chiriquí fue creado a través de un concurso en 1995, donde la ganadora Erika Bethancourt diseñó un globo terráqueo como fondo y la provincia de Chiriquí en primer plano expresando y representando a Chiriquí de mano a la humanidad y a los cambios (la modernización).
Considerando la necesidad de que la institución tenga su identidad, se elabora un Manual de Imagen Institucional, el cual tiene como objetivo, que la UNACHI pueda identificarse nacional e internacionalmente.
Cabe destacar, que el logo de la Universidad Autónoma de Chiriquí, fue registrada como marca el 23 de marzo de 2016, ante el Ministerio de Comercio e Industria y su Dirección General de Registro de la Propiedad Intelectual.